AG Pauli
Gina Kastens
PhD-Doktorandin
Dr. rer. nat. Michaela Mischak
Postdoktorandin
Prof. Dr. med. Silke Pauli
Arbeitsgruppenleiterin
Schwerpunkte
-
- Funktionelle Analysen zur Pathogenese des CHARGE-Syndroms und Kabuki-Syndroms
- Untersuchungen zur Funktion von Klasse 3 Semaphorinen in der Entwicklung und Pathogenese von syndromalen Erkrankungen
- Molekulargenetische Untersuchungen zu FBRSL1 und seiner Rolle an der Ausbildung eines neuen syndromalen Krankheitsbildes
Projekte
Funktionelle Analysen zur Pathogenese des CHARGE-Syndroms und Kabuki-Syndroms
Beim CHARGE-Syndrom (OMIM 214800) handelt es sich, wie auch beim Kabuki Syndrom (OMIM 147920, 300867) um ein klinisch heterogenes, komplexes Dysmorphiesyndrom. Ursächlich für das CHARGE-Syndrom sind Mutationen in dem Chromatinremodeller CHD7, während sich bei Patient*innen mit Kabuki-Syndrom pathogene Mutationen in den Chromatinmodifikationsproteinen KMT2D und KDM6A nachweisen lassen. Je nach Kombination der Fehlbildungen zeigen das CHARGE- und Kabuki-Syndrom klinisch deutliche Überlappungen. Insbesondere im Säuglings- und Kleinkindalter kann die klinische Unterscheidung zwischen den beiden Syndromen eine Herausforderung darstellen, wenn die typische „Kabuki-Syndrom-Fazies“ noch nicht vollständig ausgeprägt ist. Ursächlich für den ähnlichen Phänotyp ist möglicherweise, dass KMT2D, KDM6A und CHD7 in derselben Chromatinmodifikations- und Chromatin Remodelling-Maschinerie involviert sind. Die Aufklärung eines gemeinsamen pathogenetischen Mechanismus steht im Fokus dieses von der DFG geförderten Projektes.
Untersuchungen zur Funktion von Klasse 3 Semaphorinen in der Entwicklung und Pathogenese von syndromalen Erkrankungen
Semaphorine stellen eine Gruppe von transmembranen oder sekretierten Proteinen dar, die u.a. als Signalmoleküle für die Wegfindung von aussprossenden Axonen fungieren. Darüber hinaus haben sie eine wichtige Funktion in Entwicklungsprozessen, so sind sie u.a. an der Migration von Neuralleistenzellen, an der Angiogenese und am Knochenwachstum beteiligt. Anhand ihrer Domänen-Architektur und Sequenzhomologien werden Semaphorine in Subklassen unterteilt. Unsere Arbeitsgruppe beschäftigt sich bevorzugt mit Semaphorinen der Klasse 3. Wir möchten die Funktion von Klasse 3 Semaphorinen an der Pathogenese syndromaler Erkrankungen aufarbeiten. Hierzu kommen neben Zellkulturarbeiten, molekulargenetische Methoden und NGS-basierte Techniken zum Einsatz.
Molekulargenetische Untersuchungen zu FBRSL1 und seiner Rolle an der Ausbildung eines neuen syndromalen Krankheitsbildes
Wir konnten kürzlich eine Assoziation von Stop-Mutationen in einem bestimmten Abschnitt des FBRSL1-Gens mit einem bisher nicht beschriebenen syndromalen Krankheitsbild herstellen. Zu den beobachteten Symptomen gehören Gaumenspalten, Herzfehler, eine Atemproblematik, eine Schluckstörung, eine ausgeprägte kongenitale Hautfaltenbildung, die sich innerhalb des ersten Lebensjahres zurück bildet, eine Mikrozephalie und eine globale schwere Entwicklungsstörung. Die weitere Charakterisierung des neu identifizierten Fehlbildungssyndroms und die Rolle von FBRSL1 an der Pathogenese der Erkrankung ist Gegenstand dieses DFG-geförderten Projektes.
Publikationen AG Pauli
2024
Fbrsl1 is required for heart development in Xenopus laevis and de novo variants in FBRSL1 can cause human heart defects
Berger H, Gerstner S, Horstmann MF, Pauli S, Borchers A
Dis Model Mech 2024 Mar 19:dmm.050507. doi: 10.1242/dmm.050507. Epub ahead of print.
2022
Evidence of Two Novel LAMA2 Variants in a Patient With Muscular Dystrophy: Facing the Challenges of a Certain Diagnosis
Meyer S, Kaulfuß S, Zechel S, Kummer K, Seif Amir Hosseini A, Ernst MS, Schmidt J, Pauli S, Zschüntzsch J
Front Neurol. 2022 Jul 19;13:893605. doi: 10.3389/fneur.2022.893605.
2021
Comparing a Novel Malformation Syndrome Caused by Pathogenic Variants in FBRSL1 to AUTS2 Syndrome
Pauli S, Berger H, Ufartes R, Borchers A
Front Cell Dev Biol 2021 Nov 5;9:779009. doi: 10.3389/fcell.2021.779009
CHARGE syndrome and related disorders: A mechanistic link
Ufartes R, Grün R, Salinas G, Sitte M, Kahl F, Wong MTY, van Ravenswaaij-Arts CMA, Pauli S
Hum Mol Genet 2021 Jul 6:ddab183. doi: 10.1093/hmg/ddab183. Epub ahead of print.
Using Xenopus to analyze neurocristopathies like Kabuki syndrome
Schwenty-Lara J, Pauli S, Borchers A
Genesis 2021 Feb;59(1-2):e23404. doi: 10.1002/dvg.23404.
2020
De novo mutations in FBRSL1 cause a novel recognizable malformation and intellectual disability syndrome
Ufartes R, Berger H, Till K, Salinas G, Sturm M, Altmüller J, Nürnberg P, Thiele H, Funke R, Apeshiotis N, Langen H, Wollnik B, Borchers A, Pauli S.
Hum Genet. 2020 May 18.
A Novel Mutation in PIGA Associated with Multiple Congenital Anomalies-Hypotonia-Seizure Syndrome 2 (MCAHS2) in a Boy with a Combination of Severe Epilepsy and Gingival Hyperplasia
Neuhofer CM, Funke R, Wilken B, Knaus A, Altmüller J, Nürnberg P, Li Y, Wollnik B, Burfeind P, Pauli S.
Mol Syndromol. 2020 11:30-37.
2019 und früher
X-linked myotubular myopathy and recurrent spontaneous pneumothorax: A new phenotype?
Carstens PO, Schwaibold EMC, Schregel K, Obermaier CD, Wrede A, Zechel S, Pauli S, Schmidt J.
Neurol Genet. 2019 5:e327.
Homozygosity for the c.428delG variant in KIAA0586 in a healthy individual: implications for molecular testing in patients with Joubert syndrome
Pauli S, Altmüller J, Schröder S, Ohlenbusch A, Dreha-Kulaczewski S, Bergmann C, Nürnberg P, Thiele H, Li Y, Wollnik B, Brockmann K
J Med Genet. 2019 56:261-264.
Sema3a plays a role in the pathogenesis of CHARGE syndrome
Ufartes R, Schwenty-Lara J, Freese L, Neuhofer C, Möller J, Wehner P, van Ravenswaaij-Arts CMA, Wong MTY, Schanze I, Tzschach A, Bartsch O, Borchers A, Pauli S
Hum Mol Genet. 2018 27:1343-1352.
Down syndrome phenotype in a boy with a mosaic microduplication of chromosome 21q22
Schnabel F, Smogavec M, Funke R, Pauli S, Burfeind P, Bartels I
Mol Cytogenet 2018 11:62.
Novel fukutin mutations in limb-girdle muscular dystrophy type 2M with childhood onset
Smogavec M, Zschüntzsch J, Kress W, Mohr J, Hellen P, Zoll B, Pauli S, Schmidt J.
Neurol Genet. 2017 Jul 10;3(4):e167.
CHARGEd with neural crest defects
Pauli S., Bajpai R., Borchers A.
Am J Med Genet Part C. Semin Med Genet. 2017 175:478-486.
Uniparental Trisomy of a Mutated HRAS Proto-Oncogene in Embryonal Rhabdomyosarcoma of a Patient With Costello Syndrome
Menke J, Pauli S, Sigler M, Kühnle I, Shoukier M, Zoll B, Ganster C, Salinas-Riester G, Schaefer IM
J Clin Oncol. 2015 3:e62-5, doi: 10.1200/JCO.2013.49.6539. Epub 2014 Mar 17.
Cancer spectrum and frequency among children with Noonan, Costello, and cardio-facio-cutaneous syndromes
Kratz CP, Franke L, Peters H, Kohlschmidt N, Kazmierczak B, Finckh U, Bier A, Eichhorn B, Blank C, Kraus C, Kohlhase J, Pauli S, Wildhardt G, Kutsche K, Auber B, Christmann A, Bachmann N, Mitter D, Cremer FW, Mayer K, Daumer-Haas C, Nevinny-Stickel-Hinzpeter C, Oeffner F, Schlüter G, Gencik M, Überlacker B, Lissewski C, Schanze I, Greene MH, Spix C, Zenker M
Br J Cancer. 2015 112:1392-7.
Molecular Diversity and Associated Phenotypic Spectrum of Germline CBL Mutations
Martinelli S, Stellacci E, Pannone L, D’Agostino D, Consoli F, Lissewski C, Silvano M, Cencelli G, Lepri F, Maitz S, Pauli S, Rauch A, Zampino G, Selicorni A, Melançon S, Digilio MC, Gelb BD, De Luca A, Dallapiccola B, Zenker M, Tartaglia M
Hum Mutat. 2015 36:787-96.
Intragenic duplication of EHMT1 gene results in Kleefstra syndrome
Schwaibold EM, Smogavec M, Hobbiebrunken E, Winter L, Zoll B, Burfeind P, Brockmann K, Pauli S
Mol Cytogenet. 2014 23;7(1): 74.
CHD7, the gene mutated in CHARGE syndrome, regulates genes involved in neural crest cell guidance
Schulz Y, Wehner P, Opitz L, Salinas-Riester G, Bongers EM, van Ravenswaaij-Arts CM, Wincent J, Schoumans J, Kohlhase J, Borchers A, Pauli S
Hum Genet. 2014 Aug;133(8):997-1009.
CHARGE and Kabuki syndromes: a phenotypic and molecular link
Schulz Y, Freese L, Mänz J, Zoll B, Völter C, Brockmann K, Bögershausen N, Becker J, Wollnik B, Pauli S
Hum Mol Genet. 2014 15;23(16): 4396-405.
High mutation detection rates in cerebral cavernous malformation upon stringent inclusion criteria: one-third of probands are minors
Spiegler S, Najm J, Liu J, Gkalympoudis S, Schröder W, Borck G, Brockmann K, Elbracht M, Fauth C, Ferbert A, Freudenberg L, Grasshoff U, Hellenbroich Y, Henn W, Hoffjan S, Hüning I, Korenke GC, Kroisel PM, Kunstmann E, Mair M, Munk-Schulenburg S, Nikoubashman O, Pauli S, Rudnik-Schöneborn S, Sudholt I, Sure U, Tinschert S, Wiednig M, Zoll B, Ginsberg MH, Felbor U
Mol Genet Genomic Med. 2014 2(2):176-85.
Acute onset of adult Alexander disease
Schmidt H, Kretzschmar B, Lingor P, Pauli S, Schramm P, Otto M, Ohlenbusch A, Brockmann K
J Neurol Sci. 2013 331:152-4
Soft tissue perineurioma and other unusual tumors in a patient with neurofibromatosis type 1
Schaefer IM, Ströbel P, Thiha A, Sohns JM, Mühlfeld C, Küffer S, Felmerer G, Stepniewski A, Pauli S, Agaimy A
Int J Clin Exp Pathol. 2013 6:3003-8. eCollection 2013
CHD7 mutations causing CHARGE syndrome are predominantly of paternal origin
Pauli S, von Velsen N, Burfeind P, Steckel M, Mänz J, Buchholz A, Borozdin W, Kohlhase J
Clin Genet. 2012 81:234-239
Occurrence of acute lymphoblastic leukemia and juvenile myelomonocytic leukemia in a patient with Noonan syndrome carrying the germline PTPN11 mutation p.E139D
Pauli S, Steinemann D, Dittmann K, Wienands J, Shoukier M, Möschner M, Burfeind P, Manukjan G, Göhring G, Escherich G
Am J Med Genet A. 2012 158A:652-658.
Discordant phenotype in monozygotic twins with mosaic trisomy 12p in lymphocytes
Pauli S, Schmidt T, Funke R, Zoll B, Burfeind P, Dybowski U, Shoukier M, Bartels I
Eur J Med Genet. 2012 55:480-484.
Identification and characterization of FAM124B as a novel component of a CHD7 and CHD8 containing complex
Batsukh T, Schulz Y, Wolf S, Rabe TI, Oellerich T, Urlaub H, Schaefer IM, Pauli S
PLoS One. 2012 7(12):e52640
The face of Noonan syndrome: Does phenotype predict genotype
Allanson JE, Bohring A, Dörr HG, Dufke A, Gillessen-Kaesbach G, Horn D, König R, Kratz CP, Kutsche K, Pauli S, Raskin S, Rauch A, Turner A, Wieczorek D, Zenker M
Am J Med Genet A. 2010 152A:1960-1966.
CHD8 interacts with CHD7, a protein which is mutated in CHARGE syndrome
Batsukh T, Pieper L, Koszucka AM, von Velsen N, Hoyer-Fender S, Elbracht M, Bergman JE, Hoefsloot LH, Pauli S
Hum Mol Genet. 2010 19:2858-66
Proven germline mosaicism in a father of two children with CHARGE syndrome
Pauli S, Pieper L, Häberle J, Grzmil P, Burfeind P, Steckel M, Lenz U, Michelmann HW
Clin Genet. 2009 75:473-479
TC II deficiency: avoidance of false negative molecular genetics by RNA based investigations
Häberle J, Pauli S, Berning C, Koch HG, Linnebank M
J Hum Genet. 2009 54:331-334
Compound heterozygosity in the SPG4 gene causes hereditary spastic paraplegia
Pantakani DV, Zechner U, Arygriou L, Pauli S, Sauter SM, Mannan AU
Clin Genet. 2008 73:268-272.
Investigation of citrullinemia type I variants by in vitro expression studies
Berning C, Bieger I, Pauli S, Vermeulen T, Vogl T, Rummel T, Höhne W, Koch HG, Rolinski B,Gempel K, Häberle J
Hum Mutat. 2008 29:1222-1227
Mutation analysis in a German family identified a new cataract-causing allele in the CRYBB2 gene
Pauli S, Söker T, Klopp N, Illig T, Engel W, Graw J
Mol Vis. 2007 13:962-967.
SOS1 is the second most common Noonan gene but plays no major role in cardio-facio-cutaneous syndrome
Zenker M, Horn D, Wieczorek D, Allanson J, Pauli S, van der Burgt I, Doerr HG, Gaspar H, Hofbeck M, Gillessen-Kaesbach G, Koch A, Meinecke P, Mundlos S, Nowka A, Rauch A, Reif S, von Schnakenburg C,Seidel H, Wehner LE, Zweier C,Bauhuber S, Matejas V, Kratz CP, Thomas C, Kutsche K
J Med Genet. 2007 44:651-656.
Identification of novel mutations of the human N-acetylglutamate synthase gene and their functional investigation by expression studies
Schmidt E, Nuoffer JM, Häberle J, Pauli S, Guffon N, Vianey-Saban C, Wermuth B, Koch HG
Biochim Biophys Acta. 2005 1740:54-59.
Gene structure of human carbamylphosphate synthetase 1 and novel mutations in patients with neonatal onset
Häberle J, Schmidt E, Pauli S, Rapp B, Christensen E, Wermuth B, Koch HG
Hum Mutat. 2003 21:444
Mutation analysis in patients with N-acetylglutamate synthase deficiency
Häberle J, Schmidt E, Pauli S, Kreuder JG, Plecko B, Galler A, Wermuth B, Harms E, Koch HG
Hum Mutat 2003 21:593-7
Mild citrullinemia in caucasians is an allelic variant of argininosuccinate synthetase deficiency (citrullinemia type 1)
Häberle J, Pauli S, Schmidt E, Schulze-Eilfing B, Berning C, Koch HG
Mol Genet Metab. 2003 80:302-306.
Structure of the human argininosuccinate synthetase gene and an improved system for molecular diagnostics in patients with classical and mild citrullinemia
Häberle J, Pauli S, Linnebank M, Kleijer WJ, Bakker HD, Wanders RJ. Harms E. Koch HG.
Hum Genet. 2002 110:327-333